Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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