Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms