Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms