Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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