Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms