Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms