Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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