Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clcn1Q64347 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms