Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sin3aQ60520 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sin3aQ60520 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms