Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms