Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Znf608Q56A10 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf608Q56A10 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf608Q56A10 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Znf608Q56A10 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms