Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm5460Q3UQ97 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms