Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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