Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms