Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Trappc13Q3TIR1 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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