Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam107bQ3TGF2 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam107bQ3TGF2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms