Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms