Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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