Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Lrriq3Q14DL3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms