Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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