Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms