Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem52bQ0VBF2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms