Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc21bQ0HA38 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc21bQ0HA38 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc21bQ0HA38 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc21bQ0HA38 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc21bQ0HA38 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc21bQ0HA38 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ttc21bQ0HA38 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ttc21bQ0HA38 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ttc21bQ0HA38 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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