Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms