Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms