Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms