Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms