Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms