Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbp1Q00915 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms