Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms