Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shc1P98083 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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