Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms