Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp2P63044 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms