Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms