Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms