Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ClgnP52194 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms