Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CastP51125 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CastP51125 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CastP51125 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CastP51125 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms