Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TspoP50637 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TspoP50637 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
TspoP50637 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
TspoP50637 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
TspoP50637 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TspoP50637 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms