Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FmodP50608 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
FmodP50608 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms