Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SftpdP50404 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SftpdP50404 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms