Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CtshP49935 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtshP49935 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtshP49935 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms