Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtpreP49446 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms