Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rfx1P48377 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rfx1P48377 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rfx1P48377 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rfx1P48377 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rfx1P48377 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rfx1P48377 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rfx1P48377 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rfx1P48377 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rfx1P48377 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rfx1P48377 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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