Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Tnfsf9P41274 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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