Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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LtbP41155 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LtbP41155 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LtbP41155 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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LtbP41155 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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LtbP41155 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LtbP41155 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LtbP41155 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LtbP41155 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LtbP41155 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LtbP41155 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LtbP41155 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LtbP41155 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LtbP41155 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LtbP41155 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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LtbP41155 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LtbP41155 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LtbP41155 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LtbP41155 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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