Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtlP38585 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtlP38585 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtlP38585 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtlP38585 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtlP38585 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtlP38585 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TtlP38585 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TtlP38585 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
TtlP38585 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TtlP38585 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TtlP38585 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms