Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprkP35822 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprkP35822 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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