Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OatP29758 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OatP29758 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OatP29758 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OatP29758 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OatP29758 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OatP29758 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OatP29758 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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OatP29758 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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OatP29758 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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OatP29758 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OatP29758 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OatP29758 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms