Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PparaP23204 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PparaP23204 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms