Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BdnfP21237 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms